[Dmitry]

В сервисе ИМХО ты очень зря ее оставил, но что сделано, то сделано, главное голову им не давай снимать.

Во-первых правильно что поменял муфту, тем более если надо было.
Во-вторых надо прогнать воздух, только голову для этого трогать не надо, там специальные клапаны есть, их надо выкрутить и чтобы воздух вышел.
В-третьих поменяй термостат, впринципе можно конечно посмотреть работает он или нет, но если купил, то меняй. После чего опять не забудь весь воздух из системы выгнать.
В-четвертых проверь радиатор, не забит ли он пухом насмерть? Если да, то чистить или менять.
В-пятых, хоть и мало вероятно что из-за этого, но не помешало бы проверить работоспособность допвентилятора (который спереди от радиатора, его еще иногда вентилятором кондиционера называют).