Запах жаренного сцепления сложно перепутать с чем-либо еще
Скорей всего дело не в коробке тогда,снимай мкпп и смотри что там со сцепой
Для начала сцепление поменять и посмотреть заодно маховик на люфты,возможно тоже под замену. ( я бы еще задний сальник коленвала до кучи поменял )
Если не поможет тогда уже вскрывать коробку ,но полазив в эксисте и поглядев цены мне стало понятно что дешевле купить бу на разборе
PS я не люблю говорить неопределенно,но мне сложно точно ответить находясь дома и не видя глазами проблему